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爸妈,做完单细胞分选,我就回家过年了

人阅读 发布时间:2018-08-06 15:42

 

我是一只小青蛙,有一天妈妈的手机里下载了《旅行青蛙》,于是就有了我,在我长大后,成为了一只搞科研的青蛙。

 

妈妈每天在屏幕的那头呼唤我,问我为什么一直不回家,我可以想象,我的小屋一定是这样的画面:

妈妈,之所以没回家,是我要完成我的科研任务:快速有效获取单细胞!作为一只科研蛙,一定要走在科研的前列,当今单细胞研究是如此火热,在其他蛙友出去玩耍的时候,我在实验室里努力奋斗,终是小有收获。

 

好啦,科研蛙告诉你,单细胞获取的方法有哪些~

1.有限稀释法(Limiting Dilution)

有限稀释法是根据细胞悬液浓度的计算,逐步稀释得到一定体积内只有1个细胞的方法。该方法操作简单,无需特殊设备,但是由于分选基于浓度计算,无法直接观察,错误率高。

综合评价

通量:☆

操作难度:☆

分离效率:☆

 

2.显微操作法(Micromanipulator)

将细胞悬液置于显微镜下进行单细胞挑选,过程更直观,用口吸管来进行。这种方法的优势在于能够准确地控制单细胞的吸取与释放;其缺点在于通量低,对操作人员的技术要求高。

综合评价

通量:☆

操作难度:☆☆☆☆

分离效率:☆☆☆

 

3.显微切割 (Laser Capture Microdissection )

这是一种获取切片组织样本单细胞的方法,可直接观察分离样本,避免分离偏差。因此LCM技术可以从构成复杂的组织中获得某一特定同类细胞或单细胞,但是手工切割操作难度很大,而激光切割设备昂贵;在制样和切割过程中对细胞损伤大。

综合评价

通量:☆☆

操作难度:☆☆☆☆☆

分离效率:☆☆

 

4.荧光流式分选(Flow Cytometric Sorting)

对于复杂样本中特定细胞类型的分离就往往要借助流式细胞仪来进行分离了。经过荧光或者抗体标记的单细胞悬液在鞘液的包裹或推动下,以一定的速度从喷嘴喷出,喷出的液流形成液滴并在高压电场影响落入各自的收容器,从而实现细胞的分离。

 

通过流式分选的方法,能够在短时间内从复杂样本中分离大量的目的细胞,通量大,可以满足不同的后续研究需求。SONY全自动流式分选仪SH800S相较于传统的加电式分选仪,从光路校准到液流调整真正实现了全自动操作,无需任何人为调整;加之其使用的微流控芯片技术,使得分选后的细胞活力得以保障,因此避免了传统分选仪中仪器操作需要较高的熟练度、对细胞的伤害比较大这样的弊端。

综合评价

通量:☆☆☆☆☆

操作难度:☆☆

分离效率:☆☆☆☆☆

在当下,单细胞测序已是热点研究项目,而以往受限于现有单细胞分离技术而带来的高昂建库费用,使得肿瘤组织中细胞检测的数量大大降低,进而限制了组织异质性的检测能力。

目前有学者就利用索尼SH800S在单细胞分选效率及细胞完整性保护方面的优势,使用该设备分选单细胞核,同时组合索引测序,成功实现了上万个单细胞基因组文库的构建,这种方法能够快速有效的检测上千种细胞基因信息,且价格经济。

SONY所具有的索引分选(Index Sorting)模式,可追溯分选获得细胞的原初生物学属性,结合下游分子生物学研究方法,让细胞基因表型研究精确到单细胞水平。从表型到基因型的整合分析,可以系统化阐明基因表达水平和生物学属性之间的关联性。

 

所以,妈妈您放心,我已经找到了快速有效的分离单细胞的方法,就可以回去过年了!你们不要担心哦。。。

妈妈,等我回家!

 

参考文献: Sequencing thousands of single-cell genomes with combinatorial indexing.  NatureMethods2017 Mar;14(3):302-308. 

愿我们的努力为您的实验增添一份助力!

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