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分选那些事|效率,回收率,得率,傻傻分不清楚!

发布时间:2018-11-08 19:13 |  点击次数:

在日常流式细胞分选实验中,我们经常会对分选细胞质量,分选系统性能进行评估;通常使用到最多的评估指标就包括:纯度,效率,回收率,得率,活率。我们如何理解这些指标?我们对「效率,回收率,得率」名词非常熟悉,但总是傻傻分不清楚!

 

 

» 什么叫纯度,效率,回收率,得率,活率?
 

1. 分选后所得到的细胞是否全都是想要的细胞?(纯度)


2. 仪器显示分选的细胞数量占样品中目的细胞数量的百分比?(效率)


3. 实际分选得到细胞数量占仪器显示分选细胞数量的百分比?(回收率)


4. 从样品目的细胞中实际分选得到了多少目的细胞?(得率)


5. 分选后得到的细胞是否全都是活细胞?(活率)

 

» 如何计算纯度,效率,回收率,得率,活率?
 

» 举个例子:
 

假设分选门 A 门显示有 10000 个细胞(target cells in original sample),


仪器显示分选到管中有 9000 个细胞(target cells sorted as indicated e instrument),


那么效率为 90%=9000/10000 X100%;


在分选管中加入 PI,回测分选管所有细胞显示总细胞数 8000 个,其中 A 门有 6000 个,PI 阴性门有 7200 个,


那么纯度为 75%=6000/8000 X100%;


活性率为 90%=7200/8000 X100%;


回收率为 66.7%=6000/9000 X100%;


得率为 60%=6000/10000 X100%。

 

由此可见,经常在流式软件上看到的分选效率并不等于分选得率!如果要计算分选得率,需要上机回测分选管中目标细胞的数量。因此,分选效率可以在分选过程中由软件实时计算结果;而分选得率必须在分选实验结束后上机回测才能计算结果。

 

参考文献:Rmax:A systematic approach to evaluate instrument sort performance using center stream catch. Methods 82 (2015) 64–73.